La Comisión de Coordinación del Consejo de Cooperación Amazónica (CCOOR), conformada por los Embajadores de los Países Miembros de la OTCA acreditados ante el Gobierno del Brasil, es un órgano de naturaleza consultiva y auxiliar del Consejo de Cooperación Amazónica. Realiza el seguimiento de la planificación, programación y ejecución presupuestaria de la SP y evalúa las actividades desarrolladas en el ámbito del Tratado, formulando recomendaciones sobre diversas materias de su competencia al Consejo de Cooperación Amazónica.